Maken-Ki Phần 2 là câu chuyện kể tiếp về cuộc sống của anh chàng học sinh có tên là Takeru, trong phần này anh đã dần quan với môi trường mới của mình, anh đã có bạn bè, anh quen những cô gái xung quanh, khiến cho cuộc sống của Takeru trở lên vui nhộn hơn, không còn cô đơn như trước nữa. Tuy nhiên vì là một ngôi trường kì lạ với nhiều thành phần người khác nhau, lại sở hữu những năng lực đặc biệt lên đôi khi cuộc sống của Takeru cũng trở lên khá rắc rối với những chuyện xảy ra xung quanh.
